📋 实验流程
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模板与引物准备
20 min准备 DNA 模板(基因组 DNA/质粒/cDNA),设计并合成上下游引物。
💡 技巧 引物设计时 GC 含量控制在 40–60%,避免发夹结构和二聚体。
⚠️ 注意 模板浓度过高会抑制反应,一般 10–100 ng 为宜。
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2
配制反应体系
15 min在冰上配制 PCR 反应体系:缓冲液、dNTP、引物、模板、DNA 聚合酶、水。
💡 技巧 配制 Master Mix(先混公共组分再分装)可减少加样误差。
⚠️ 注意 全程冰上操作,最后加入 DNA 聚合酶,避免酶失活。
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3
PCR 扩增(循环反应)
1.5 h设定程序:95°C 变性 30s → 55–65°C 退火 30s → 72°C 延伸,循环 30–35 次。
💡 技巧 退火温度通常 = 引物 Tm − 5°C,条带不特异时先优化退火温度。
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4
电泳检测
40 min取 5 µL 产物跑琼脂糖凝胶电泳,用 DNA Marker 对照,紫外观察条带。
💡 技巧 加 loading buffer 后再上样,便于沉降和观察。
⚠️ 注意 EB/核酸染料有毒性,戴手套操作并妥善处理废液。
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⚠️ 新手常犯的 4 个错误(避坑指南)
- ① 忘了加引物或模板:反应体系缺关键组分,扩增不出来。
- ② 退火温度不对:太高扩不出、太低非特异条带多。
- ③ 污染:气溶胶污染导致假阳性,务必分区操作、换枪头。
- ④ 循环数过多:30–35 次足够,过多会导致非特异扩增和错配。
❓ 常见问题(做坏了怎么办)
+没有条带怎么办?
排查:① 引物/模板缺失 ② 酶失活 ③ 退火温度过高 ④ 模板降解。
+出现非特异条带怎么办?
提高退火温度、减少循环数、优化引物特异性。
+条带很淡怎么办?
增加模板量、增加循环数、或提高聚合酶量。